1.6 Dicas de organização do trabalho
Você irá manipular diversos arquivos durante a execução de qualquer projeto e precisa organizar os arquivos para não se perder e poder voltar a eles quando necessário.
A grande vantagem de realizar a análise de dados, produção de figuras etc, no R é criar um processo replicável, e é preciso ser bem organizado com os arquivos para poder reutilizar o processo com novos dados ou adaptá-lo para novas análises. Isso implica, entre outras coisas, em:
Organizar o projeto em uma pasta no seu computador exclusiva para ele;
Definir um critério lógico para dar nome aos arquivos do projeto;
Organizar arquivos em subpastas segundo a necessidade, por exemplo, uma subpasta para dados, outra para figuras, outras para tabelas geradas e outros resultados. Pode inclusive colocar a criação dessas pastas nos scripts do R, que ele cria na pasta de trabalho (‘getwd()’) que deve ser a pasta do seu projeto através de (funções do R para manipular arquivos e pastas);
O código dos seus scripts devem ser escritos de forma genérica para que ele possa ser usado com qualquer outro conjunto de dados que tenha a mesma estrutura que os seus (variáveis). Ou seja, o código deve ser escrito não em função do conteúdo dos seus dados mas apenas na estrutura (i.e. as colunas dos seus dados) deles. Esta é a chave para uma programação eficiente e para a replicabilidade. Isso significa que um resultado obtido a partir dos seus dados não deve ser manualmente atribuído a nenhum objeto no script, apenas atribuído a partir do objeto contendo o resultado.
A definição da pasta de trabalho (working directory) é fundamental simplificar a leitura de dados e salvar arquivos sem se preocupar com o caminho completo (full path) para cada arquivo, mas apenas o caminho relativo (relative path). Por exemplo, um arquivo numa pasta de projeto pode ter como caminho completo /home/usuario/Desktop/meuprojeto/dados/morfometricos.xlsx, e o caminho relativo à pasta de trabalho seria apenas dados/morfometricos.xlsx.
Da mesma forma para salvar resultados a partir do R.
O RStudio (RStudio Team 2020) facilita esse processo para você, permitindo que você crie um projeto.
Um projeto basicamente consiste em definir uma pasta de trabalho para que, toda vez que você abrí-lo, a pasta que contem o arquivo de término .Rproj seja a sua pasta de trabalho. Alternativamente, você pode simplesmente indicar a pasta de trabalho toda vez que iniciar uma atividade utilizando as funções setwd() no console ou em um script.