1.3 R-base e pacotes
Como vimos acima, um script do tipo função é um objeto que executa um conjunto de comandos e recebe argumentos que modificam o que o script realiza. Existem dois tipos de funções:
Funções do pacote
base- funções que vêm junto com o R quando você faz o download do programa, como por exemplo as funçõeslength(),order(),sort(),sum(),mean()etc;Funções de pacotes externos - pacotes (
packagesem inglês) são funções criadas por colaboradores e organizadas em pacotes que você pode baixar dos repositórios do R.
As funções do pacote base vêm junto com o programa e você não precisa se preocupar com isso.
Pacotes, por outro lado, devem ser instalados pelo usuário conforme a necessidade.
Por exemplo, para trabalhar com dados filogenéticos, você pode necessitar do pacote ape (Paradis et al. 2020), que já tem várias funções preparadas para análises filogenéticas.
Se você necessitar deste pacote, por exemplo, basta executar o seguinte comando no console do R:
install.packages("ape")Para trabalhar com pacotes você primeiro precisa definir um repositório, ou seja, um servidor, de vários disponíveis (espelhos do repositório oficial), de onde o R buscará o pacote desejado. Pode-se também o menu do R ou do RStudio para instalar pacotes e definir um repositório padrão para sua instalação.
Como tudo no R, você pode executar comandos que estão no menu usando funções. Por exemplo, ao invés de usarmos o menu do R para definir um repositório e instalar um pacote, vamos executar estas ações por meio de um script:
# isso pode não funcionar se estiver no INPA por causa do Proxy.
chooseCRANmirror() # seleciona repositório
install.packages("ape", dependencies = TRUE) # instala o pacote Ape